Composto destacadamente por fotografias e em processo de organização, o acervo iconográfico do CM conta com aproximadamente 5.000 imagens registradas entre os anos de 1923 e 2009, referindo-se a temas como:

• higiene nas cidades (no Brasil e no exterior);
• saúde de crianças e adolescentes;
• saúde do trabalhador;
• saúde ambiental;
• habitações;
• educação sanitária;
• entomologia médica;
• postos de saúde;
• hospitais;
• instituições de ensino e pesquisa em saúde;
• água e saneamento;
• documentação do edifício da Faculdade de Saúde Pública;
• retratos e imagens de eventos de profissionais da saúde pública;